Фамилия Зыяков — не самая распространённая, и её происхождение уходит в тюркские языки, скорее всего, в татарский или башкирский. Основа фамилии — личное имя Зыя, которое представляет собой вариант арабского имени Зия (Дия), означающего «свет», «сияние», «блеск». В мусульманских культурах такие имена давали с пожеланием, чтобы жизнь человека была светлой и заметной. Русский суффикс -ов, присоединённый к основе, — стандартная модель образования фамилий у многих народов Поволжья и Приуралья, входивших в состав Российской империи: так фиксировалась принадлежность к роду, «сын Зыя» или «внук Зыя».

Интересная особенность — написание через «ы» (Зыя вместо Зия). Это не ошибка, а отражение реального произношения в некоторых тюркских диалектах, где звук «и» в начале слова мог огубляться или переходить в более твёрдый «ы». Такая фонетическая адаптация встречается в татарских и башкирских фамилиях, например, параллельно существуют Зияев и Зыяев. Фамилия Зыяков, следовательно, может быть вариантом, закрепившимся в конкретном роде или регионе, где говор наложил отпечаток на письменную фиксацию.

Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами из татарских или башкирских селений. Точных сведений о сословной принадлежности по самой фамилии нет — тюркские фамилии на -ов не указывают на дворянство или духовенство, это массовая модель, возникшая в XIX веке при переписях и паспортизации. Если искать однокоренные фамилии, то это Зияев, Зыяев, Зиятдинов (где «тдин» — вера, религия), но Зыяков стоит особняком из-за редкого суффиксального оформления: суффикс -к- (в форме Зыяк) мог возникнуть как уменьшительно-ласкательный вариант имени в тюркской среде, что делает фамилию не просто «сын Зыя», а скорее «сын Зыяка» — то есть потомок человека, которого в быту называли ласково или по-свойски.

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области. Встречаемость невысокая, что говорит о сравнительно недавнем закреплении, возможно, в одном-двух родах. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла записываться по-разному: Зыяков, Зияков, Зыяковъ — вариативность была обычным делом.