Фамилия Абагуев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Абагуев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Абагуев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Абагуев образована от восточного мужского имени Абаг, которое в переводе на русский язык означает «горная вода». Согласно другой гипотезе, фамилия Абагуев ведет свое начало от прозвища Абагуй, основой для которого послужило тюркское нарицательное «абаг», что в переводе на русский язык означает «воля». Вероятно, прозвище отражало особенности характера и поведение основателя фамилии (свободный, независимый человек). Существует также версия, по которой фамилия Абагуев восходит к топониму Абагуй — это название села, расположенного в Забайкальском районе Читинской области. В этом случае можно предположить, что предок обладателя фамилии Абагуев был уроженцем этого села, либо долгое время проживал в нем. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Абагуев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Абагуев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.