Фамилия Абаис встречается редко, и её происхождение неочевидно. Сразу заметно, что она не славянская: в ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ев или -ин, которые обычно добавляли к основе. Это подсказывает, что фамилия пришла из тюркской или кавказской среды, где запись имени могла закрепиться почти без изменений.

Основа здесь — «абай» или «аба». В казахском и башкирском языках «абай» означает «осторожный», «осмотрительный» и нередко встречается как личное имя. В других тюркских языках «аба» — это «отец», «предок» или уважительное обращение к старшему. Конечное -ис в русском написании могло появиться как адаптация местного окончания или как часть составного имени, которое при записи слилось в одно слово.

Если смотреть на модель образования, то Абаис — это фамилия-прозвище или фамилия-имя, которую зафиксировали без русификации. Такое типично для народов Поволжья, Северного Кавказа или Средней Азии: русские чиновники записывали имя человека дословно, а потомки наследовали эту запись как фамилию. Отсутствие суффикса указывает либо на относительно позднее оформление фамилии, либо на то, что она не прошла полную адаптацию.

Версия о связи с арабским словом «абас» (хмурый, суровый) маловероятна. В русской передаче это имя обычно даёт фамилию Абасов, а не Абаис — разница в окончании существенна и указывает на другой корень. Таким образом, Абаис, вероятнее всего, означает «осторожный» или «почтенный». Географически её стоит искать в среде татар, башкир, казахов или у народов Дагестана, где такие основы широко распространены. Встречаемость фамилии крайне низкая, поэтому её носители, скорее всего, связаны родством в пределах одного региона или даже одного села.