Фамилия Абалухова — женская форма фамилии Абалухов, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Абалух. В русской ономастике это редкий случай, когда в основе лежит не каноническое крестильное имя, а местное, диалектное слово.

Корень «Абал-» или «Опал-» в южнорусских и украинских говорах имеет значение «обманщик, плут» или «тот, кто обманывает, морочит». Слово «абалух» (или «обалух») фиксируется в словарях как прозвище хитрого, изворотливого человека. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище Абалух за свой нрав или за конкретный поступок. Суффикс «-ов» в мужской форме указывает на принадлежность: «сын Абалуха» или «из рода Абалуха».

Географически фамилия тяготеет к регионам, где были распространены эти говоры: Курская, Орловская, Воронежская области, а также восток Украины. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальный, а не общерусский характер. В отличие от фамилий от церковных имён (Иванов, Петров), Абалухова — пример фамилии, образованной от мирского прозвища, которое могло закрепиться за человеком и перейти к потомкам.

Версия о связи с тюркским словом «аба» (отец) или «абы» (старшая сестра) маловероятна: суффикс «-лух» нехарактерен для тюркских языков, а конечное «-х» типично именно для русских диалектных форм. Поэтому основная гипотеза — чисто славянская, прозвищная, без иностранных корней.