Фамилия Абзеев образована от тюркского прозвища или почтительного обращения. В башкирском и татарском языках слово «абза» или «абзей» означает «старший родственник», «дядя по отцу» или «уважаемый старший». В ряде тюркских диалектов «абзей» — это обращение к мужчине, старшему по возрасту или положению. Таким образом, Абзеевы — потомки человека, которого в окружении величали Абзеем, и это прозвище закрепилось как фамильное имя.

Модель образования фамилии классическая для русского востока: тюркская основа на согласный плюс русский патронимический суффикс -ев. Суффикс указывает на принадлежность: «сын Абзея». Если бы основа оканчивалась на -а, появился бы вариант Абзеин, но здесь именно мужская форма имени. Такой тип фамилий особенно характерен для татарских, башкирских и мишарских родов, которые вошли в состав Русского государства и чьи имена адаптировались под русскую грамматику.

Существует диалектный вариант — Апзеев, где звонкий «б» заменяется на глухой «п». Это типично для некоторых говоров Поволжья и Приуралья, где оглушение согласных в начале слова встречается часто. Поиск по архивам показывает, что основная масса носителей фамилии исторически сосредоточена на территории современного Башкортостана, в меньшей степени — в Татарстане и Оренбургской области. Это подтверждает связь с башкирским родоплеменным укладом, где обращение «абзый» было нормой.

В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается в двух написаниях: Абзеев и Абзеевъ. Сословно предки чаще всего были государственными или тептярскими крестьянами, реже — представителями башкирского дворянства (князьями или тарханами), но без дополнительных генеалогических изысканий утверждать это для конкретной ветви нельзя. Фамилия не получила широкого распространения за пределами Урало-Поволжья, поэтому её носители до сих пор сохраняют довольно плотную региональную привязку.