Фамилия Афонюшкины — один из вариантов фамилий, образованных от имени Афанасий. В основе лежит уменьшительно-ласкательная форма Афонюшка. Имя Афанасий греческого происхождения и означает «бессмертие». Такие «домашние» варианты имени были широко распространены в быту: в документах человека могли записать не полным именем, а тем, как его звали родные и соседи.

Фамилия построена по продуктивной русской модели: к основе Афонюшк- добавился суффикс принадлежности -ин, который указывал на родство. Первоначально Афонюшкин означало «сын Афонюшки» или «человек из семьи Афонюшки». Со временем притяжательное прилагательное закрепилось в качестве наследственной фамилии.

Обратите внимание на форму множественного числа — Афонюшкины. В русской традиции фамилии на -ин/-ын во множественном числе часто обозначали целый род или династию. В старых переписных книгах могли писать «двор Афонюшкиных», имея в виду всех домочадцев. Такая форма фамилии характерна для северных и центральных областей России, где было принято называть семьи по родоначальнику.

Поскольку имя Афанасий было одним из самых распространённых на Руси, фамилии от его производных (Афоня, Афонька, Афонюшка) встречаются во многих регионах. Точное место возникновения фамилии Афонюшкины установить сложно — процесс закрепления фамилий шёл несколько столетий. Но сама форма с суффиксом -ушк- в основе указывает на то, что прозвище носило ласковый, семейный оттенок, а не официальный.