Фамилия Афтанаки — редкий пример, в котором переплелись иранские, греческие и тюркские языковые следы. Её основа — имя или прозвище Афтан, а суффикс -аки указывает на греческое происхождение: в греческой ономастике этот суффикс характерен для фамилий с острова Крит и некоторых областей Малой Азии, часто образуя уменьшительные или патронимические формы (как Иванаки, Панагиотаки). Поэтому носитель фамилии Афтанаки — это, скорее всего, «потомок Афтана» в грекоязычной среде.

Сам корень «Афтан» имеет как минимум две версии происхождения. Первая ведёт к иранскому «афт/авд» — «семь». Слово «авдан» (или «афтан») дословно означало «колыбель для семерых детей». Имя Афтан могли дать седьмому ребёнку в семье — такой обычай встречается у многих народов, где числовые имена указывали на очерёдность рождения. Вторая версия — греческая: от слова «афтос» — «сам». В этом случае прозвище Афтан мог получить человек, который всё делал своими руками, был крепким хозяином, возможно, владел большим домом и не нанимал работников.

Какая из версий правдоподобнее? Иранский корень выглядит более древним и конкретным: числовые имена — устойчивая модель в тюркских и иранских языках (сравните фамилии Бирюков, Третьяков). Греческое «афтос» — более позднее и менее типичное для прозвищ, хотя полностью исключать его нельзя. Скорее всего, имя Афтан, попав в греческую среду (например, через греков Причерноморья или Малой Азии), получило суффикс -аки и закрепилось в форме фамилии. Так иранская по корню основа обросла греческим окончанием — типичная история для многонационального региона Северного Причерноморья и Крыма, где веками жили греки, тюрки и иранские народы.