Фамилия Афтинюк — редкий случай, когда географический ключ важнее корня. Её носители почти поголовно встречаются на западе Украины, особенно в Волынской и Ровенской областях. Суффикс -юк сразу указывает на волынскую или подольскую модель образования фамилий: так на этих землях называли сына или потомка человека по его имени, прозвищу или занятию. То есть Афтинюк — это «чей?» — Афтинов, Афтинович, но по местной традиции.

Корень Афтин- — наиболее спорная часть. Самая вероятная версия: это фонетический вариант имени Автоном (греч. «самозаконный, независимый»). В украинских говорах начальное «авт» нередко переходило в «афт» — так же, как Авксентий превращался в Афксентий. Менее вероятно, хотя и возможно, происхождение от греческого Евтихий (счастливый, удачливый) через форму Евти́н → Афтин. Третья версия — прозвище от диалектного глагола «афтiти» (тяжело дышать, задыхаться), но это слово узколокальное и не дало массовых фамилий, поэтому версия с именем убедительнее.

Социальный срез фамилии типичен для западноукраинского крестьянства XVIII–XIX веков. Суффикс -юк в тех краях почти не использовался шляхтой (у неё были -ский/-цкий), зато был основным у свободных селян и казаков. Афтинюки, скорее всего, были хлеборобами или мелкими ремесленниками, а фамилию закрепили в период фиксации фамилий при австрийской администрации Галиции и Волыни (конец XVIII — первая половина XIX века).

Любопытно, что фамилия почти не вышла за пределы западных областей Украины. В России она встречается единично — это следы поздних миграций XX века. В написании путаницы нет: вариант Афтенюк встречается, но редко, и объясняется просто небрежностью писарей, которые на слух записывали «е» вместо «и». Ударение стабильно на последний слог — Афтиню́к, что тоже характерно для волынской модели с суффиксом -юк.