Фамилия Агафошина — женская форма, её основа, мужская фамилия Агафошин, построена по распространённой модели с суффиксом принадлежности -ин. Исходное имя — крестильное Агафон, от греческого «агатос» (добрый, хороший). Однако в фамилии явно слышится уменьшительно-ласкательный суффикс -ош-, который превращает полное имя в обиходную форму Агафоша. Такие «домашние» варианты имён (Тимоша от Тимофей, Дороша от Дорофей) в XV–XVII веках активно переходили в прозвища, а затем и в фамилии, закрепляя за человеком внутрисемейное прозвание.

Здесь стоит обратить внимание на разницу с фамилиями на -ов/-ев. Те обычно указывали на отчество по отцу (Иван Петров — сын Петра). Фамилии на -ин в русской традиции нередко фиксировали прозвище или уменьшительное имя, которое давали не только по отцу, но и по матери, если она была вдовой или играла заметную роль в доме. Поэтому Агафошин мог означать «сын Агафоши» — человека, которого в кругу близких звали ласково, по-свойски, а не полным именем.

Географически фамилия встречается в основном в центральных и северных регионах России, где была сильна традиция «окающего» произношения и уменьшительных форм. В документах XVII века, например в переписных книгах Вятки и Устюга, попадаются крестьяне с именем Агафошка, что подтверждает бытование этой формы среди простого люда. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это верный признак крестьянского или посадского происхождения.

Не путайте Агафошина с фамилиями от того же корня, но с другим суффиксом: Агафонов (от полного имени) или Агашкин (от просторечного Агашка). Агафошин стоит особняком именно благодаря суффиксу -ош-, который придаёт фамилии оттенок теплоты и указывает на то, что предок был в своём окружении «своим», а не просто «сыном Агафона». Если ваша фамилия Агафошина, скорее всего, ваши предки жили в северной или центральной России, были крестьянами или посадскими людьми, а родоначальника в семье звали ласково — Агафоша.