Фамилия Аганьян — армянская по происхождению, что видно по характерному суффиксу -ян. В армянской ономастике этот суффикс выполняет ту же роль, что русские -ов или -ин: он указывает на принадлежность к роду, буквально «из семьи такого-то» или «потомок такого-то». Таким образом, Аганьян — это «потомок Агана».

Основа фамилии — личное имя Аган, которое в свою очередь восходит к армянскому Ահան (Аган) или, что вероятнее, является вариантом имени Аганес — армянской формы библейского имени Иоанн (Иван в русской традиции). Имя Аганес означает «милость Божья» или «Бог помиловал». В армянском языке есть и другое имя — Агван, но оно имеет иное происхождение и связано с древним названием Кавказской Албании. Скорее всего, Аган — это сокращенная или диалектная форма от Аганес, широко распространенная в разных областях исторической Армении.

Географически фамилия Аганьян чаще всего встречается в Армении, а также среди армянских диаспор в России, США, Франции и на Ближнем Востоке. В России носителей фамилии можно встретить в Краснодарском крае, Ставрополье и Ростовской области — регионах, где исторически селились армяне. В самой Армении фамилия больше характерна для западных областей, таких как Ширак или Лори, но точная привязка к одному селу или городу не установлена.

Интересная деталь: в некоторых русских документах XIX — начала XX века фамилию могли записывать как Аганьянц, с добавлением русского патронимического суффикса -ц, что отражает попытку адаптировать армянскую фамилию к местной бюрократической традиции. Такие варианты встречаются в метрических книгах армянских церквей на юге России.

Социальный статус предков носителей фамилии, скорее всего, был разным: от ремесленников и торговцев до крестьян. Армянские фамилии на -ян не указывают на дворянство или духовенство — они универсальны для всех сословий. Поэтому сказать, что все Аганьяны происходят из какого-то одного сословия, нельзя.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Аганян (без мягкого знака) — более распространенный вариант, а форма Аганьян встречается реже и может указывать на особенности произношения в конкретном диалекте (например, в карабахском или зейтунском говорах).