Фамилия Агбальянц — редкий пример армянской фамилии, которая, скорее всего, не была переделана на русский лад, а сохранила исходный патронимический суффикс -янц. Этот суффикс в армянском языке указывает на происхождение от предка: «Агбальянц» буквально значит «из рода Агбаля» или «потомок Агбаля». В отличие от более частого русского окончания -ов/-ев, -янц (или -ян) выдаёт армянские корни носителя.

Основа фамилии — личное имя или прозвище Агбаль. Скорее всего, оно восходит к тюркскому или арабскому слову «агба» (белый, светлый, седой) — такие прозвища давали либо за цвет волос, либо за почтенный возраст. В армянской среде, особенно в регионах, где веками жили рядом с тюркскими народами (например, в Западной Армении или Нагорном Карабахе), тюркские заимствования в именах и прозвищах были обычным делом. Менее вероятная версия — связь с армянским словом «агб» (источник, родник), но тогда форма была бы скорее Агбян, а не Агбаль.

Географически фамилия Агбальянц тяготеет к восточноармянским областям, где окончание -янц (вместо западного -ян) более характерно для диалектов. Встречается она редко, и это может говорить о том, что род был немногочисленным или локальным. В Российской империи носители такой фамилии могли быть ремесленниками, торговцами или крестьянами, но точных сословных данных по этой фамилии нет — в доступных списках мещан и купцов XIX века она почти не фигурирует.

Особенность написания — конечное «ц» вместо более привычного «ц» в русской передаче армянских фамилий (сравните: Ованесянц, Арутюнянц). Это не ошибка, а фонетическая особенность: в армянском языке звук на конце может передаваться как «ц» в зависимости от диалекта. Так что Агбальянц — не искажение, а один из вариантов записи, который закрепился в документах.