Фамилия Агеян — армянская, и это видно сразу по суффиксу -ян. В армянской ономастике он работает как русские -ов/-ев или -ин: указывает на происхождение или родство. Буквально Агеян значит «из рода Аге» или «потомок Аге». Основа — мужское имя Аге, которое в армянском восходит к греческому Аггеос (Hagios) — «святой». Через христианскую традицию имя вошло в армянский именослов, и от него пошли фамилии Агеян, Агоян, Агекян. В говорах имя могло звучать как Агэ, но письменная форма закрепилась через «е».

Географически фамилия встречается прежде всего в Армении и в армянских диаспорах — в России, США, Франции, Ливане. В Российской империи армянские фамилии на -ян часто русифицировали, заменяя окончание на -ов, поэтому в старых метриках можно наткнуться на вариант Агеев. Исходная форма сохранилась там, где армянский язык оставался родным. Сословно носители не привязывались к одному кругу: крестьяне, ремесленники, купцы — имя Аге (святой) было распространено во всех слоях. В XIX веке, когда армяне активно переселялись в торговые центры России, фамилия Агеян встречалась среди купечества и духовенства.

Стоит отличать Агеян от похожих русских фамилий вроде Агеев. У них разная морфология: русская фамилия образована от имени Агей (тоже через греческий «святой») с патронимическим суффиксом -ев, а армянская — с суффиксом -ян. Внешнее сходство случайно, и путать их не стоит — это две разные ономастические традиции.