Фамилия Агеян — армянская по происхождению, что сразу видно по суффиксу -ян. В армянской ономастике этот суффикс выполняет ту же роль, что русские -ов/-ев или -ин: он указывает на принадлежность, происхождение, родство. Буквально Агеян означает «из рода Аге» или «потомок Аге».

Основа фамилии — мужское имя Аге, которое в армянском языке восходит к греческому Аггеос (Hagios) — «святой». Через христианскую традицию имя вошло в армянский именослов, и от него образовались фамилии Агеян, Агоян, Агекян. В некоторых говорах имя могло звучать и как Агэ, но письменная форма закрепилась через «е».

Географически фамилия Агеян распространена прежде всего в Армении и в армянских диаспорах — в России, США, Франции, Ливане. В Российской империи армянские фамилии на -ян часто русифицировали, заменяя окончание на -ов, поэтому в старых метриках можно встретить вариант Агеев, но исходная форма сохранилась в среде, где армянский язык оставался родным.

Сословно носители фамилии не были привязаны к какому-то одному кругу: крестьяне, ремесленники, купцы — имя Аге (святой) было распространено во всех слоях. В XIX веке, когда армяне активно переселялись в торговые центры России, фамилия Агеян встречалась среди купечества и духовенства.

Стоит отличать Агеян от похожих русских фамилий вроде Агеев. У них разная морфология: русская фамилия образована от имени Агей (также через греческий «святой») с патронимическим суффиксом -ев, а армянская — с суффиксом -ян. Внешнее сходство случайно, и путать их не стоит — это разные ономастические традиции.