Фамилия Агмалова — женская форма, мужская — Агмалов. Основа фамилии — личное имя или прозвище Агмал. В таком виде оно встречается у тюркских народов и имеет прозрачную структуру: корень «аг» (белый, чистый, благородный) и аффикс «-мал», который может указывать на обладание качеством. Таким образом, Агмал — «обладающий белизной», «светлый», «чистый». В переносном смысле — человек с чистой душой, благородный.

Фамилия Агмалова — явно тюркского происхождения, скорее всего, татарского, башкирского, казахского или ногайского. На это указывает и сама модель: фамилии на -ов/-ев у тюркских народов Поволжья и Кавказа часто образовывались от имён без дополнительных суффиксов, просто добавлением русского патронимического окончания. Встречается фамилия и у аварцев, и у кумыков. В дагестанских языках «агмал» может соотноситься с понятием «работа», «труд», но это менее вероятно — скорее всего, это омонимия.

Интересная деталь: написание фамилии через «г» (Агмалов, а не Акмалов) указывает на звонкое произношение корня в исходном языке. В русской записи звонкий заднеязычный звук сохранился, не оглушился. Это отличает фамилию от, скажем, Акмаловых, у которых корень мог звучать как «ак» (белый) в твёрдом варианте. Регионально фамилия Агмалова чаще всего фиксируется в Татарстане, Башкортостане, а также в Астраханской области среди карагашей (одной из групп ногайцев).

Социальный состав носителей — в основном крестьяне и сельские жители, что типично для фамилий, образованных от личных имён без указания на профессию или сословие. Никакой особой знатности за этой фамилией не числится, но и редкой её не назовёшь — она встречается стабильно, но не массово.