Фамилия Аиткуловы — один из тех случаев, когда русская письменность закрепила тюркское имя, а суффикс -ов адаптировал его под восточнославянскую модель. В основе лежит мужское личное имя Аиткул, бытовавшее у башкир, татар и казахов. Имя составное: первая часть «Аит» (варианты Айет, Ает) восходит к арабскому «аят» — «знак», «чудо», «стих Корана». Вторая часть — «кул» — с тюркских языков переводится как «раб», но в составе имён означает «раб Божий», «слуга Всевышнего». Получается, что Аиткул — это «раб, отмеченный божественным знаком». Фамилию образовали по стандартной патронимической модели: к основе Аиткул прибавили русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?»). Аиткулов — буквально «сын Аиткула». Форма множественного числа — Аиткуловы — подчёркивает родовую принадлежность, то есть целую семью.

Географически фамилия тяготеет к Южному Уралу и Зауралью. Наибольшая концентрация носителей — в Республике Башкортостан, особенно в западных и южных районах, а также в соседних Оренбургской и Челябинской областях. Это указывает на башкирское происхождение большинства Аиткуловых, хотя отдельные ветви могли быть татарскими. Интересна вариативность написания. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках встречаются формы Аиткулов, Айткулов, Аеткулов. Разница в первой гласной (Аи- / Ай- / Ае-) отражает особенности местного произношения: в башкирском и татарском языках звук на стыке «а» и «й» мог передаваться по-разному. При записи русскими чиновниками этот звук фиксировался на слух, отсюда и разнобой.

Сословно Аиткуловы, скорее всего, относились к тептярям или государственным крестьянам из башкир — не к дворянству, а к податному сословию, занимавшемуся скотоводством и земледелием. Встречаются упоминания Аиткуловых среди участников Первой мировой войны из Уфимской губернии — рядовые, ополченцы. Знаменитых исторических личностей с этой фамилией нет, что типично для фамилии, образованной от распространённого тюркского имени и не попавшей в дворянские родословные книги.

Родственными по основе будут фамилии Аитов, Аетов, Айтов (от сокращённой формы Аит) и Кулов (от второй части имени). Однако Аиткуловы стоят особняком, сохраняя полную двукорневую структуру исходного имени — редкий случай, когда сложное личное имя не редуцировалось, а целиком перешло в фамилию.