Фамилия Ахинько — редкий случай, когда географический разрез говорит больше, чем этимологический. Основной ареал её бытования — западные области Украины и юг Беларуси, что сразу указывает на украинскую или белорусскую природу фамилии. Суффикс -енко характерен для украинских фамилий, но здесь мы видим форму -инько, которая встречается реже и свойственна в основном Полесью и Гродненщине.

Происхождение основы Ахинь- неочевидно и имеет несколько версий. Самая вероятная — от крестильного имени Афанасий в его народной форме Ахин (через Ахон, Афон). Такое стяжение характерно для разговорной речи: Афанасий → Ахин, а затем с уменьшительным суффиксом -ьк- и фамильным -о. В этом случае Ахинько — «маленький Ахин» или «сын Ахина», то есть потомок человека, которого в быту звали Ахин.

Менее распространённая версия связывает фамилию с диалектным словом «ахинея» (вздор, чепуха), но это маловероятно. В народных говорах слово «ахинька» могло означать нечто незначительное или даже ласковое обращение к ребёнку, но письменных подтверждений такого прозвища почти нет. Если основа и восходит к прозвищу, то скорее ироническому — так могли назвать рассеянного или говорливого человека.

Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская по происхождению. В ревизских сказках XIX века Ахинько встречаются в Волынской и Минской губерниях, что подтверждает её региональную привязку. Необычный суффикс -инько делает фамилию отличимой от массовых -енко, и это её главная словообразовательная особенность: перед нами не стандартная украинская модель, а более архаичная, локальная.