Фамилия Ахкубегова — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка можно определить по самому звучанию. Это типично карачаево-балкарская фамилия, и её основа указывает на горный Северный Кавказ, а не на славянскую или тюркскую среду Поволжья.

Разбираем словообразовательную модель. Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов/-ев, который в данном случае адаптирует кавказскую основу к паспортной системе Российской империи. Без этого суффикса фамилия звучала бы как Ахкубег. Корень здесь сложный: первая часть «Ах» — это, скорее всего, усечённое арабское имя Ахмед (Ахмат), очень популярное у мусульманских народов Кавказа. Вторая часть «кубег» — более спорная. Самая вероятная версия: это искажённое или диалектное произношение тюркского слова «кёбек» (кюбек) — «щенок», «детёныш». В карачаево-балкарском языке «кюбек» может использоваться и как ласкательное прозвище для младшего ребёнка, и как тотемное имя.

Таким образом, исходное прозвище Ахкубег (или Ахмат-кюбек) могло означать «Ахмед-щенок» — в том же смысле, в каком у русских бытовали прозвища Волчонок, Медвежонок или Лисёнок: ласковое имя для мальчика, данное по звериной ассоциации. Другая, менее правдоподобная версия выводит «кубег» из тюркского «кюбе» — «свадебный дар», «калым». Но она не объясняет конечного «г» и не подкрепляется параллельными фамилиями в регионе.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Ахку́бегова. Встречаются варианты написания через букву «о» — Ахкубёгова, что может отражать местный говор. Носители фамилии сосредоточены в Кабардино-Балкарии и Карачаево-Черкесии, а также в диаспорах этих народов в Турции и Сирии (куда многие горцы переселились после Кавказской войны в XIX веке). Социально предки Ахкубеговых были свободными общинниками или узденями (дворянами), но не князьями — фамилия не содержит княжеского суффикса -евы/-вы.

Для сравнения: однокоренные фамилии того же корня — Кюбегов, Кубегов, Кобеков — встречаются у балкарцев и кумыков, что подтверждает именно тюркскую, а не арабскую природу второй части основы.