Фамилия Ахкуева — редкий случай, когда географический указатель сильнее личного имени. Перед нами не отчество и не прозвище, а указание на место, откуда родом предок. Основа «Ахку» — это искажённое или диалектное название населённого пункта, скорее всего, аула Ахку (или Ахк) на Северном Кавказе, в горной Чечне или Ингушетии. Суффикс «-ев» здесь работает как топонимический показатель — «из Ахку», «ахкуевский».

Типичная модель для фамилий народов Кавказа, которые оформлялись по русской административной традиции в XIX веке. При переписях и призыве на службу жителям давали фамилию по названию родного села. Так Ахкуевы — это не потомки человека по имени Ахку, а выходцы из конкретного места, аула Ахку (сейчас на территории Чеченской Республики). Вторая, менее вероятная версия — от тюркского мужского имени Ахку (вариант Акку, «белый лебедь»), но для кавказского ареала топонимическое объяснение выглядит убедительнее.

Фамилия почти не встречается за пределами Кавказа. В метрических книгах и ревизских сказках конца XIX века Ахкуевы фиксируются в Грозненском и Веденском округах Терской области. Социальный состав — в основном горцы-скотоводы и земледельцы, редко — военные из местных ополчений. Суффикс «-ев» вместо более привычного «-ов» указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или гласный: Ахку + ев, без твёрдого окончания.

В современной России фамилия остаётся малочисленной. Носители сосредоточены в Чечне, Ингушетии и среди диаспоры в других регионах. Сравнение с однокоренными фамилиями — Ахкулов, Ахкуев — показывает, что все они отсылают к одному корню «ахк» (чечен. «вершина», «гора»), что дополнительно подтверждает горное происхождение.