Фамилия Ахмалиддинова — редкий пример сложной арабско-персидской модели, адаптированной под русскую грамматику. Она образована от мужского имени Ахмалиддин, которое, в свою очередь, составное. Первая часть — Ахмад (один из эпитетов пророка Мухаммеда, означает «достохвальный»), вторая — ад-Дин («вера», «религия»). Вместе имя переводится как «хвала вере» или «прославленный верой». Женский суффикс -ова указывает, что носительница — потомок человека по имени Ахмалиддин (дочь или жена).

Такие длинные теофорные (связанные с религией) имена характерны для народов, испытавших влияние ислама: таджиков, узбеков, отчасти азербайджанцев и народов Дагестана. В русской среде фамилия появилась через паспортную фиксацию, когда советские ЗАГСы записывали сложные восточные имена по принципу «как слышится, так и пишется», отсюда двойное «дд» в середине.

В отличие от простых фамилий на -ов, образованных от односложных основ (Иванов, Петров), Ахмалиддинова — пример «цепной» антропонимии: её основа сама состоит из двух полноценных имён. В исламской традиции такие имена давали в знак благочестия, часто в семьях потомственных религиозных деятелей, мулл или учителей медресе. Поэтому предки носительницы фамилии с высокой вероятностью были связаны с духовным сословием или образованием.

Географически фамилия тяготеет к Средней Азии, особенно к Ферганской долине, где исторически переплетались таджикский и тюркский языки. Встречается она редко: по открытым данным, в России её носят единицы, и почти все — женщины, так как мужской вариант (Ахмалиддинов) фиксируется ещё реже. Это объясняется тем, что в советское время длинные составные имена часто упрощали или заменяли, а оригинальная форма сохранилась лишь в нескольких семьях.

С точки зрения словообразования, фамилия необычна тем, что сохранила полную структуру арабского имени без редукции. В русском языке ударение, скорее всего, падает на предпоследний слог: Ахмалидди́нова, хотя в исходном имени ударным был последний слог (Ахмалидди́н). Такая перестановка — типичный след русификации, когда фамилия подстраивается под привычную модель склонения.