Фамилия Ахмиденова — редкий пример того, как составное арабское имя прошло через тюркскую языковую среду и получило русский фамильный суффикс. В её основе лежит мужское имя Ахмеддин (или Ахмаддин), которое соединяет два корня: «ахмад» — «прославленный» (эпитет пророка Мухаммада) и «дин» — «религия, вера». Имя Ахмеддин буквально означает «прославленный в вере» или «слава религии», и в традиционных мусульманских семьях его давали с пожеланием, чтобы ребёнок вырос достойным и благочестивым человеком.

Фамилия образована по русской модели: к основе Ахмеддин (в бытовом произношении сократившейся до Ахмиден) добавили суффикс -ов, который в женском роде даёт окончание -а. Такая адаптация восточных имён типична для фамилий тюркского и арабского происхождения, которые оформились в России в XIX–XX веках. Фонетический переход «е» в «и» (Ахмеддин → Ахмиден) — естественный процесс в живой речи, когда безударный гласный редуцируется.

Процесс формирования фамилий у разных сословий шёл неравномерно, и без конкретных генеалогических документов сложно сказать, где именно и когда Ахмиденовы получили свою фамилию. Однако по типу суффикса и основе можно предположить, что это сравнительно поздняя фамилия, возникшая в среде татарского или кавказского населения, контактировавшего с русской административной системой. Сравните с более частыми однокоренными фамилиями Ахмадеев, Ахметдинов, Ахмидов — все они восходят к тому же корню, но различаются по суффиксам и степени обрусения. Ахмиденова стоит в этом ряду как вариант с усечением и редукцией, что делает её одной из самых компактных по звучанию.