Фамилия Аксёшины — редкий пример того, как полное церковное имя превратилось в обиходное прозвище, а затем закрепилось в родовом имени. В основе лежит мужское имя Авксентий (от древнегреческого «ауксано» — растущий, увеличивающийся). В быту это длинное имя сокращали до коротких и ласковых форм: Авксёша, а затем и Аксёша. Такой переход — «Ав» в «А» — обычное дело для русской народной речи (сравните: Авдотья — Дунька, Авксентий — Аксёша).

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Аксёшины — буквально «чьи?» — дети, родня человека по имени Аксёша. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от имён, прозвищ или профессий, оканчивающихся на -а или -я (например, Ильин, Пушкин, Кузьмин). В данном случае суффикс присоединился к основе Аксёш-, что даёт характерное окончание -ин, а не -ов.

Поскольку имя Авксентий было календарным, его давали при крещении в честь святого Авксентия, почитаемого в православии. В крестьянской и мещанской среде такие «домашние» варианты имён нередко вытесняли полную форму и передавались по наследству как фамилии. О точном месте возникновения фамилии Аксёшины говорить сложно — она могла появиться в разных губерниях независимо, где жил человек с таким прозвищем. Но в целом фамилия довольно редкая: её нет в списках массовых русских фамилий, и встречается она преимущественно в центральных и северных областях России.

Интересная деталь: в некоторых говорах форма «Аксёша» могла относиться не только к Авксентию, но и к имени Ксенофонт (через промежуточный вариант «Аксён»). Однако для фамилии Аксёшин основная версия — именно от Авксентия, так как «Ксенофонт» давал бы форму Ксёшин или Ксенофонтов.