Фамилия Актюбин — редкий случай в русской ономастике, где топонимическое происхождение почти не вызывает споров. В отличие от большинства фамилий, образованных от прозвищ, имён или профессий, эта прямо указывает на географическую точку. Основа — Актюба. Так назывались несколько населённых пунктов в исторических Оренбургской и Уфимской губерниях, а также в Казахстане. Само слово «Актюба» тюркского происхождения: «ак» — белый, «тюбе» — холм, вершина. То есть «Белый холм». Человек, получивший фамилию Актюбин, скорее всего, был выходцем из села или деревни с таким названием, либо его предки переселились оттуда.

Суффикс -ин указывает на модель «чей?»: Актюбин — сын человека из Актюбы. Это типичный патронимический (точнее, топонимический) суффикс, как, например, в фамилиях Москвин, Тверитин или Казанин. Форма на -ов (Актюбов) встречалась бы, если бы основа оканчивалась на твёрдый согласный, но здесь мягкое окончание «а» дало именно -ин.

Географически фамилия привязана к юго-восточным регионам России и северному Казахстану. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках Актюбины встречаются среди крестьян и мещан Оренбургской губернии. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения: это не массовый вариант вроде Казакова или Орлова, а локальное, редкое образование. Возможно, её носители — потомки переселенцев, которые взяли фамилию по месту выхода, а не по месту жительства, что было характерно для крестьянских фамилий, оформившихся позже дворянских.

Стоит упомянуть, что фамилия Актюбин не связана с казахским городом Актобе (бывший Актюбинск). Город получил название от той же основы, но фамилия образована от более старого села, а не от крупного города, который стал областным центром только в XX веке. Поэтому искать корни в современном Актобе — ошибка.