Фамилия Актубин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. С первого взгляда она напоминает топонимические фамилии вроде Орлов, Калугин или Тамбовцев, где основой служит название города или реки. И действительно, самая прямая версия связывает её с казахстанским городом Актобе (в прошлом — Актюбинск). В таком случае Актубин — это вариант фамилии Актюбинский, упрощённый по модели «город + -ин» (как, например, Казань → Казанин). Носитель фамилии мог быть выходцем из этих мест или иметь предка, которого прозвали по месту жительства.

Однако здесь есть тонкость. Суффикс -ин в русских фамилиях обычно присоединяется к основам на -а/-я (Петя — Петин, Москва — Москвин). Основа «Актюб(а)» дала бы скорее «Актюбин», а не «Актубин». Написание через «у» во втором слоге — «Актубин» — может указывать на иной путь: от прозвища или имени собственного, заимствованного из тюркских языков. В тюркских наречиях «ак» — белый, чистый, а «туб» (түп) — дно, корень, основа. Возможна основа «Актуба» — прозвище человека со светлыми волосами или с устойчивым характером («крепкий корень»). В таком случае фамилия образована по той же модели, что и Барабин, Кулундин — от тюркского географического или личного имени.

Версия с Актюбинском выглядит более массовой и вероятной, особенно если учесть, что город Актюбинск стал активно расти в конце XIX — начале XX века, и переселенцы могли получить фамилию по новому месту жительства. Но написание через «у» — не ошибка, а либо диалектное произношение (устная передача), либо указание на другой, более старый корень. Фамилия Актубин встречается крайне редко, в основном на юге России и в Казахстане. Сословная принадлежность предков не прослеживается — скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая не раньше середины XIX века.