Фамилия Акубжанов происходит от сложного составного имени Акубжан, которое, в свою очередь, восходит к арабской и персидской традициям. Первая часть имени — Акуб — представляет собой фонетический вариант имени Якуб (арабская форма библейского Иакова), что означает «сопутствующий», «сопровождающий», «идущий следом» или «не отстающий». Вторая часть — Жан — происходит от персидского «джан» («душа»). Таким образом, имя Акубжан можно перевести как «душа, идущая следом» или «верный спутник души».

Модель образования фамилии типична для многих тюркских и ирано-тюркских народов: к основе Акубжан добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Акубжана»). Встречается и вариант написания Акубжанов, где «ж» отражает мягкое произношение исходного звука, характерное для казахского, узбекского или татарского языков.

Фамилия распространена преимущественно среди народов Средней Азии и Поволжья, особенно у казахов и узбеков, где составные имена с компонентом «жан» («душа») очень популярны. Социально предки носителей фамилии могли быть из разных слоёв — от ремесленников и скотоводов до духовных лиц, поскольку имя Якуб почитается в исламе как имя пророка.

С точки зрения ономастики, фамилия Акубжанов интересна тем, что в ней соединились два разных языковых пласта: семитский корень (через арабский) и иранский аффикс. Это делает её ярким примером культурного и языкового синтеза на Великом шёлковом пути. В отличие от фамилий, образованных от чисто тюркских или чисто арабских имён, Акубжанов демонстрирует смешанную традицию именования, где «душа» (жан) присоединяется к имени пророка, придавая ему ласковый или почтительный оттенок.