Фамилия Аладжанян — один из наглядных образцов того, как армянская модель фамилий вбирала в себя иноязычные корни. Её основа восходит к тюркскому или арабскому слову «аладжа» (alaca), которое в разных диалектах означало «пёстрый», «разноцветный» или «пёстрая ткань». В армянской среде это слово закрепилось как прозвище: Аладжа могли дать человеку за пёструю одежду, рябое лицо или просто за необычную, яркую внешность. Суффикс «-ян» (в диалектах «-янц») — стандартный армянский патронимический показатель, указывающий на принадлежность к роду: Аладжанян буквально значит «из рода Аладжа». Если бы фамилия сохранила более древнюю форму суффикса, она звучала бы как Аладжанянц — такие варианты встречаются, но редко.

Встречается и вторая, менее вероятная версия: связь с арабским именем Аладжан (Alajan), которое носили в некоторых мусульманских семьях. Но для армянской фамилии прямая заимствованная антропонимическая основа — редкость, чаще брали нарицательное прозвище. Поэтому версия с прозвищем от «пёстрый» считается основной.

Географически фамилия Аладжанян распространена в основном среди армян, происходящих из Западной Армении (исторические области Васпуракан, Сасун) и из региона Киликии. После геноцида 1915 года носители фамилии расселились по всему миру — в России, США, Франции, Ливане, Сирии. В самой Армении фамилия встречается, но не входит в число самых частых.

По сословной принадлежности предки Аладжанянов, скорее всего, были ремесленниками или торговцами тканями. Корень «аладжа» прямо указывает на пёструю материю, которой в восточных городах торговали на базарах. Но точных документальных подтверждений этому нет — фамилия не даёт привязки к дворянству или духовенству, а значит, перед нами типичная фамилия городского или сельского сословия.

В написании фамилии возможны варианты: Аладжанян, Аладжаньян, реже — Аладжанянц. Встречается и форма Аладжанян без удвоения «н», что связано с особенностями передачи армянской фонетики на русский язык. При переезде носителей в другие страны написание могло меняться под влиянием местных орфографических норм.