Фамилия Алапеус — редкий случай в русском ономастиконе. Сразу бросается в глаза нехарактерное для исконно русских фамилий окончание -ус. Такое окончание — верный признак того, что перед нами фамилия искусственного, книжного происхождения, а точнее — семинарская.

В духовных училищах и семинариях XVIII–XIX веков будущим священникам часто меняли фамилии на более благозвучные, латинизированные или грецизированные. Алапеус — это латинская переделка греческого слова «алапа» (ἀλαπά), что означает «слабость, изнеможение, бессилие». В церковнославянском языке это слово закрепилось в значении «немощь», «болезненность». Семинарскую фамилию Алапеус могли дать либо слабому здоровьем ученику, либо, что вероятнее, в память о каком-то евангельском сюжете или поучении, где говорится о человеческой немощи.

Вторая версия, менее популярная, но тоже имеющая право на существование, связывает основу с греческим «алапа» в значении «хитрость, коварство». Однако в семинарской традиции предпочитали благочестивые толкования, так что версия с «немощью» выглядит правдоподобнее.

По словообразовательной модели фамилия стоит особняком: суффикса -ов или -ин здесь нет, потому что это не отчество, а цельное латинизированное прозвище. Встретить Алапеуса можно было исключительно в среде православного духовенства, и географически такие фамилии разбросаны по всей Российской империи, без привязки к одному региону. Носители этой фамилии — потомки тех самых семинаристов, получивших «говорящее» имя, которое должно было напоминать о смирении и бренности человеческой природы.