Фамилия Алайцева — женская форма фамилии Алайцев. Её основа, Алаец, почти наверняка восходит к прозвищу или мирскому имени, которое давали человеку за какую-то особенность. Самое прямое и правдоподобное объяснение — связь со словом «алай» или «алая». В старых русских говорах, особенно на юге и западе, «алаем» называли шумную толпу, ватагу, гурьбу. «Алай» — это и крик, гам, содом. Прозвище Алаец мог получить крикливый, шумный человек, заводила или, наоборот, тот, кто постоянно попадал в суматоху.

Менее вероятная, но тоже возможная версия — от тюркского «ала» (пёстрый, рябой) или от названия реки Алай (есть в Пермском крае и других регионах). В таком случае прозвище могло указывать на внешность (рябой, пёстрый) или на место жительства (с Алая). Однако для фамилии, оканчивающейся на -цев, типичнее образование от прозвища, а не от топонима — топонимические фамилии чаще имеют суффикс -ский.

Суффикс -ев (в мужском варианте -цев) указывает на принадлежность: «Алайцев» буквально значило «сын Алайца» или «человек из семьи Алайца». Это так называемая «патронимическая» модель, самая распространённая в русских фамилиях. Фамилия недворянская — такие фамилии на -ев и -ов в массе своей закрепились за крестьянами и посадскими людьми в XV–XVII веках, когда составлялись писцовые книги и переписи.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и южных областях России, а также среди казачества — там, где были живы говоры со словом «алай». Сравните с однокоренными фамилиями Алаев, Аланин, Алайников — все они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Алайцева — одна из самых редких в этом ряду, что делает её особенно ценной для семейной истории: носителей мало, а значит, велика вероятность, что все они — потомки одного общего предка, получившего прозвище Алаец несколько столетий назад.