Фамилия Алекян — типичный пример армянской родовой фамилии. Её основа — имя Алек, которое в армянском языке чаще всего выступает как сокращённая форма имён Алексей или Александр. Имя Алексей восходит к древнегреческому «алексо» — «оберегать», «защищать», а Александр означает «защитник людей». Таким образом, через имя-основу фамилия несёт значение защиты и оберега.

Фамилии с суффиксом -ян (в старой орфографии -янц) — самая распространённая модель армянской антропонимии. Этот суффикс восходит к притяжательному значению: первоначально он означал «из семьи такого-то» или «из рода такого-то». Соответственно, Алекян — «из рода Алека». В армянской традиции такие фамилии заменяли отчества и указывали на клановую принадлежность, что зафиксировано и в самом армянском термине «азганун» — «имя клана».

В отличие от многих армянских фамилий, которые после вхождения Восточной Армении в состав Российской империи получили русские суффиксы -ов/-ев (например, Алекян мог бы превратиться в Алекянов), фамилия Алекян сохранила исконную форму. Это говорит о том, что её носители либо жили в регионах, где русификация не была массовой, либо принадлежали к семьям, сознательно державшимся за национальную модель именования.

Стоит учитывать, что имя Алек могло быть и самостоятельным, не обязательно производным от Александра или Алексея. В армянском ономастиконе встречаются имена, созвучные с греческими заимствованиями, но имеющие собственные корни. Впрочем, связь с христианскими именами Алексей и Александр остаётся наиболее вероятной — оба имени были широко распространены в Армении благодаря православию и культурным связям с Византией.

Географически фамилия Алекян встречается как в самой Армении, так и в диаспоре, особенно в тех общинах, которые сохранили армянский язык и традиции. Поскольку фамилия не подверглась русификации, её носители в России и странах бывшего СССР часто сохраняют написание через «я», что сразу указывает на армянское происхождение.