Фамилия Алфаритов — редкий случай, когда в основе фамилии не имя, не прозвище и не профессия, а, скорее всего, книжное, искусственно созданное слово. Судя по корню, она образована от греческого «альфа» — первой буквы алфавита. Суффикс -итов типичен для фамилий семинарского происхождения, которые в XVIII–XIX веках давали выпускникам духовных училищ и семинарий. Такие фамилии часто сочиняли наставники, желая облагородить или «онаучить» фамилию ученика, либо давали как прозвище за успехи в учёбе.

Вероятнее всего, Алфаритов — это переделка исходной фамилии Алфавитов или Алфавитский, что прямо указывает на связь с грамотой. В семинарской среде фамилии на -итов были особенно распространены: они звучали по-латыни и подчёркивали образованность. Если предок носителя был сыном дьячка или пономаря, ему могли дать фамилию Алфаритов как знак того, что он освоил азбуку и приступил к изучению Псалтири. Встречается также вариант Алфаритов с ударением на второй слог — Алфа́ритов, что ближе к греческому произношению.

Географически фамилия привязана к центральным и южным губерниям Российской империи, где было много духовных училищ: Курская, Орловская, Тамбовская, Рязанская. В современных базах данных Алфаритов — крайне редкая фамилия, её носители встречаются в основном на юге России и в Москве. Другие версии, например, связь с греческим словом «алфари» (мука) или тюркским корнем, маловероятны: фамилия слишком явно «книжная» и не имеет бытовых параллелей в народной среде.

Интересная деталь: среди однокоренных фамилий — Алфавитов, Алфавитский, Альфа — Алфаритов стоит особняком из-за суффикса -итов, который редко встречается за пределами семинарского круга. Это делает фамилию почти точным маркером сословного происхождения: её носитель, скорее всего, потомок человека, получившего начальное духовное образование и фамилию за знание азбуки.