Фамилия Алфавитова — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не прозвище и не профессия, а отвлечённое понятие. Корень здесь — слово «алфавит», но напрямую с грамотностью или обучением предок мог быть и не связан. В русской ономастике подобные фамилии относят к «искусственным» или «семинарским»: их часто придумывали в духовных училищах и семинариях для учеников, чьи природные фамилии казались начальству неблагозвучными или «простонародными». Семинаристу могли дать фамилию по названию учебного предмета, праздника, церковного термина — и «Алфавитов» (а затем и женская форма Алфавитова) из этого же ряда.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель, но в данном случае «Алфавитов» — не «сын Алфавита», а скорее «носящий фамилию, произведённую от слова алфавит». В мужском варианте фамилия фиксируется в документах XIX века среди выпускников духовных академий, особенно в центральных губерниях. Женская форма Алфавитова, соответственно, возникла как вариант для замужних женщин или дочерей в семьях духовенства, где фамилии передавались по мужской линии.

Есть, впрочем, и другая, менее вероятная версия: в некоторых говорах «алфавитом» в шутку могли называть человека, который любит вставлять в речь сложные слова или, наоборот, путается в буквах. Но доказательств бытования такого прозвища в крестьянской среде нет, а все достоверные записи фамилии ведут в сословие священно- и церковнослужителей. Так что если ваши предки — Алфавитовы, с большой вероятностью они имели отношение к церковной школе или приходу.