Фамилия Алгалиева — наглядный пример того, как арабское имя, пройдя через тюркскую языковую среду, закрепилось в русской паспортной форме. В основе лежит мужское имя Алгали, которое образовалось от сращения арабского определённого артикля «ал» с именем Али. Али означает «высокий», «возвышенный», «могущественный» — это одно из ключевых имён в исламе, принадлежавшее четвёртому праведному халифу, двоюродному брату и зятю пророка Мухаммеда. В тюркских языках, заимствовавших арабские имена через исламскую традицию, артикль часто прирастал к корню, давая такие формы, как Алгали, Альберди и т.п.

Словообразовательная модель фамилии прозрачна и не вызывает споров. К основе Алгали добавлен патронимический суффикс -ев, типичный для русских фамилий, образованных от отчества. Таким образом, Алгалиев — это «сын Алгали», а Алгалиева — женская форма, означающая «дочь или жена Алгалиева». Фамилия возникла в среде татар, башкир, казахов и других тюркских народов, исповедующих ислам, которые в XIX–XX веках при получении паспортов записывали свои имена и отчества по русским образцам. Географически фамилия чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, а также среди казахских и ногайских родов.

Ударение в русском произношении обычно падает на второй слог: АлгАлиева, хотя в тюркских языках возможен акцент на последний слог. В ономастических словарях, например у Б. Унбегауна, фамилии на -ев от мусульманских имён описаны как типичные для «русских мусульман» — крещёных или некрещёных татар, принявших русскую фамильную форму. Это редкий случай, когда этимология не вызывает разногласий среди исследователей: корень очевиден, иных значений (от географических названий или профессий) не зафиксировано.