Фамилия Альканова — редкий случай, когда географический и этнический след в основе перевешивает стандартную славянскую модель. При беглом взгляде бросается в глаза суффикс -ов, типичный для русских фамилий, образованных от имени или прозвища отца. Однако корень «Алькан» в русской ономастике не встречается в качестве крестильного имени. Здесь работает другая логика.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. Основа «Алькан» восходит к тюркскому слову «алкан» — «первенец» или «старший сын». В татарском, башкирском и казахском языках это слово употреблялось как личное имя или прозвище для обозначения статуса ребёнка в семье. Фамилия на -ов, закрепившаяся в русской среде, часто фиксировала такие прозвища у татарских мурз, башкирских старшин или представителей других тюркских народов, перешедших на русскую фамильную модель в XVIII–XIX веках.

Менее распространённая, но имеющая право на существование версия — связь с арабским именем Алькан (от «аль-кан» — «закон», «правило»). В этом случае фамилия могла возникнуть в среде мусульманских народов Кавказа или Поволжья, где арабские имена через тюркское посредничество входили в быт. Однако тюркская версия выглядит правдоподобнее, потому что «алкан» как бытовое прозвище встречается в метрических книгах и переписях чаще, чем редкое арабское имя.

Географически фамилия Альканова тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области. Встречается она и в среде кавказских народов, но там чаще фиксируется вариант без суффикса — просто Алькан. Фамилия не была распространена в центральных русских губерниях, что подтверждает её региональный и этнический характер.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлена по русскому образцу, но основа осталась иноязычной. Это типичная картина для «окраинных» фамилий Российской империи: нерусский корень плюс русский фамильный формант. Носитель фамилии Альканова в XIX веке с высокой вероятностью происходил из татарского или башкирского сословия — либо из служилых татар, либо из торговых людей, либо из крестьян, принявших фамилию по отцу-первенцу.