Фамилия Алкисева — редкая и неоднозначная по происхождению. В её основе лежит прозвище или имя Алкись, и у исследователей есть как минимум три версии того, что оно означало.

Первая гипотеза опирается на мордовские языки. Слово «алкине» переводится как «малорослый, низкий». Если эта версия верна, прозвище Алкись дали невысокому человеку. Вторая версия ведёт на северо-запад, в балтийские земли. Алкись могло быть формой древнего литовского имени Алкис — так звали одного из героев литовских сказок, великана. Само же имя восходит к древнегреческому Алкинус («волевой, сильный»). В этом случае предок носителя фамилии мог получить имя в честь сказочного силача.

Третья гипотеза — фонетическая. Фамилия Алкисева могла возникнуть как вариант фамилии Алкишев. Тогда прозвище Алкиш (или Алкис) связывают с древнетюркским словом «алкиш» — так тюркские народы называли жанр гимнического прославления предков. Само слово «алкиш» этимологически восходит к древнеиранскому «алас» — «горящий уголь». Если верна эта версия, основоположник рода мог быть поэтом или сказителем, мастером в жанре алкиш. Какая из гипотез ближе к истине, сказать сложно, но каждая из них открывает свою историю: от внешности до ремесла и фольклорных корней.