Фамилия Алтыншин — редкий случай, когда тюркская основа соединилась с русским суффиксом, но не с тем, который ожидаешь увидеть чаще всего. На первый взгляд корень «алтын» (тюрк. «золото») ясен, а вот суффикс «-шин» заставляет задуматься. В русской модели фамилий на -ин всё обычно: основа на -а или -я даёт -ин (Петя — Петин), на согласный — -ов (Пётр — Петров). Здесь же основа «Алтынш»? Такого имени или прозвища в тюркском обиходе нет.

Вероятнее всего, перед нами не русский суффикс -ин, а тюркский аффикс принадлежности -шин, который встречается в фамилиях у башкир, татар и казахов. Он означает «сын такого-то» или «принадлежащий такому-то». То есть Алтыншин — это буквально «сын Алтынши» или «из рода Алтынши». А вот само имя Алтынша — уменьшительно-ласкательная форма от Алтынбай, Алтынхан или Алтынгәрәй, где «алтын» — золото, а «-ша» — ласкательный суффикс, как в именах Ильшат, Ринатша. Таким образом, предок носителя фамилии был, скорее всего, башкиром или татарином по имени Алтынша, и фамилия закрепилась за его потомками в той форме, в какой её записали русские писцы: услышав «Алтыншин», они оставили окончание без изменений, не переделывая его в «Алтыншов» или «Алтыншев».

Географически фамилия привязана к южному Уралу и Зауралью — Башкортостану, Челябинской, Оренбургской областям. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальное происхождение от конкретного родового имени. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к башкирским или татарским тептярям, государственным крестьянам или служилым людям — среди них «золотые» имена были распространены как знак достатка или пожелание богатства.

Интересно, что фамилия Алтыншин не имеет ничего общего с русским словом «алтын» (старинная монета в 3 копейки) — это случайное звуковое совпадение. В тюркской среде «алтын» всегда означало именно металл, а не денежную единицу. Поэтому искать в предках менял или купцов, торговавших алтынами, не стоит: корень здесь чисто именной, а не прозвищный по профессии.