Фамилия Алуханян построена по классической армянской модели: основа плюс родовой суффикс «-ян». Разберёмся, что стоит за этой основой. Скорее всего, «Алухан» — это сложносоставное личное имя или прозвище. Первая часть, «Ал-», может восходить либо к тюркскому «ал» (красный, алый), либо к арабскому «али» (высокий, возвышенный). Вторая часть, «-ухан», — это «хан», то есть правитель. Получается, имя Алухан могло означать «красный хан» (прозвище по яркой внешности) или «великий хан» (титул, указывающий на знатное происхождение). Есть и более прозаичная версия: что Алухан — это диалектная форма личного имени Алух, связанного с арабским словом «алух» (семья, род).

Суффикс «-ян» в армянских фамилиях — прямой аналог русских «-ов» и «-ин»: он указывает на принадлежность к роду. Алуханян буквально означает «из рода Алуха» или «потомок Алухана». Такая модель стала массовой в XIX веке, когда в Закавказье начали обязательную фиксацию фамилий. В отличие от русских фамилий, где суффикс часто привязан к местности, армянский «-ян» универсален — он не даёт географической подсказки и встречается по всей Армении.

Географически фамилия чаще всего встречается в Армении, особенно в областях Арагацотн и Ширак, а также в диаспоре — в России, Грузии и США. В метрических книгах Эриванской губернии конца XIX века можно найти более архаичный вариант написания: Алуханьянц или Алуханянц. Суффикс «-янц» указывал на родовую общину и сегодня почти не употребляется, но в исторических документах он попадается регулярно.

Социальный состав носителей был разнообразным: среди Алуханянов встречались и ремесленники, и торговцы, и священники. В армянской среде фамилии не были жёстко сословными, поэтому Алуханяном мог быть и крестьянин, и купец. Известных носителей, вошедших в общероссийские энциклопедии, немного, но в региональных архивах есть записи об Алуханянах — участниках Первой мировой войны и советских инженерах.

Однокоренные фамилии — Алуханянц, Алуханов — восходят к тому же корню, но различаются способом адаптации в русском языке. Вариант «Алуханов» — результат канцелярского упрощения XIX века, когда армянский суффикс при переписи заменяли на русский. Сегодня эта форма встречается редко, но в старых документах её можно увидеть.