Фамилия Алуханов — редкая. Её основа «Алухан» с высокой вероятностью восходит к тюркскому или кавказскому личному имени. Это имя составное: первая часть «Алу-», вторая — «-хан». «Хан» — традиционный титул или компонент имени, указывающий на знатное происхождение или уважение. Первая часть «Алу» может быть искажением имени Аллах (Алухан = Алахан, где «Ала» — бог по-тюркски) либо восходить к древнетюркскому слову «ал» — «алый, красный» или «передовой, славный». В любом случае имя Алухан означало что-то вроде «великий хан» или «хан от Бога».

Фамилию образовали от этого имени по русской модели с суффиксом -ов. Это указывает на формирование в русской языковой среде: предка звали Алухан, а его потомки стали Алухановы. Такая модель типична для народов, вошедших в состав Российской империи, где фамилии давали по имени отца. Алухановы — это, скорее всего, тюркский или кавказский род, принявший русскую фамильную форму.

Географически фамилия встречается в основном на Северном Кавказе (Дагестан, Чечня, Ингушетия), а также среди тюркских народов Поволжья и Закавказья. В отличие от многих фамилий на -ов, здесь нет славянского корня. Словообразовательная модель проста: имя Алухан + суффикс -ов. Фамилия не имеет вариантов с другими суффиксами (например, Алухановский или Алухановых), что говорит о её сравнительно позднем оформлении, вероятно, в XIX — начале XX века, когда фамилию фиксировали в документах при переписях или воинской службе.

Точного значения имени Алухан не установлено. Известна параллель: в тюркских языках есть имя Алу (или Ала) — «пегий, пёстрый», а также «святой». В сочетании с «хан» это могло быть прозвище человека с необычной внешностью или духовного лидера. Другая версия — от арабского «али» (высокий, возвышенный) через диалектные искажения. Правдоподобнее всего тюркская основа, так как суффикс -ов и имя «хан» типичны именно для тюркского ареала.

Сведений о массовом дворянском происхождении Алухановых нет — фамилия скорее крестьянская или горская, не попавшая в родословные книги. В советское время носители фамилии встречались в среде интеллигенции и рабочих, но широкой известности не получили.