Фамилия Атлуханова — женская форма от мужской Атлуханов, и её основа восходит к составному тюркскому имени Атлухан. Первая часть, «атлы», означает «конный», «всадник» или «имеющий коня», вторая — «хан», титул верховного правителя. Имя Атлухан, таким образом, можно перевести как «хан-всадник» или «конный хан»: это не бытовое прозвище, а титулованное именование, указывающее на знатность, воинскую доблесть и высокое положение предка.

Словообразовательная модель проста: к основе Атлухан добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском варианте — -ова). Важно, что суффикс здесь не отвечает на вопрос «чей?», а служит стандартным способом русификации тюркских имён. Фамилия закрепилась в русскоязычной среде или в регионах, где оформление фамилий шло по русскому образцу.

Географически фамилия Атлуханова наиболее характерна для народов Северного Кавказа, в первую очередь для чеченцев и ингушей. В вайнахской ономастике имя Атлухан — традиционное, и фамилия Атлухановы — одна из распространённых в Чечне и Ингушетии. Встречаются варианты написания: Атлуханов (без смягчения) и Атлухан — как фамилия без русского суффикса, что ближе к исконной записи.

В отличие от многих тюркских фамилий, образованных от профессий или внешних признаков, Атлуханова несёт отчётливый отпечаток властной иерархии. Носители этого имени в прошлом, скорее всего, принадлежали к военной или родовой знати. Само имя — не простое, а титулованное, что говорит о высоком положении предка. По сути, это яркий пример того, как тюркское имя с титульным значением через русскую патронимическую форму стало наследственной фамилией, сохранив память о конном воине-правителе в роду.