Фамилия Алушкин образована от имени или прозвища Алушка. Чаще всего Алушка — это уменьшительная форма женского имени Алла. Имя Алла имеет сложную и спорную этимологию: с греческого его переводят как «воскресение», с древнеарабского — «буква», с готского — «другая». В доисламской Аравии Алла была богиней неба и дождя, женской параллелью Аллаха. В разных регионах её почитали как дочь Аллаха или его супругу, а в Набатее и Пальмире отождествляли с Афиной. Пророк Мухаммед уничтожил главное святилище Аллы в городе Таиф, но запретил трогать деревья и охотиться на его территории. Имя Алла было довольно популярно в городах, и от его уменьшительной формы Алушка и возникла фамилия.

Выпадение согласной «л» (Алушка вместо Аллушка) — не случайность, а результат исторических языковых процессов: в живой речи сочетания согласных могли упрощаться, чтобы имя звучало легче. Такое стяжение встречается во многих русских фамилиях, образованных от имён с удвоенными или стекающимися согласными.

Существует и другая, менее распространённая версия. Согласно ей, Алушка — это форма еврейского имени Алуш, которое в буквальном переводе означает «дикое место». В Библии Алушем назывался один из станов израильтян во время исхода из Египта, точное местоположение которого не установлено. Если принять эту версию, фамилия Алушкин могла возникнуть в еврейской среде, а затем, через контакты и миграции, закрепиться в русском языке. Однако первая версия — от женского имени Алла — выглядит более правдоподобной и типичной для русской ономастики, где фамилии на -ин часто образуются от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а.

В любом случае, фамилия Алушкин — пример того, как за одним звучанием могут скрываться разные корни: от древнего божества до библейской географии.