Фамилия Алякундов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, стоит оттолкнуться от суффикса. В русских фамилиях суффикс -ов чаще всего указывает на притяжательность: «чей?» — «Алякундов». Значит, в основе лежало личное имя или прозвище Алякунд.

Самая вероятная версия связывает это прозвище с татарским или башкирским именем. В тюркских языках есть имя Алякун (или Алякунд), которое состоит из двух частей: «ал» (возможные значения — «алый», «красный», «возьми», «герой») и «кун» (день, солнце). Встречаются варианты Алякун, Алягун, Алякунды. Под влиянием русской речи и письменной фиксации конечное -д могло появиться как оглушение или наращение, характерное для заимствованных слов (сравните: «арестант» из немецкого, хотя в оригинале без «д»). Таким образом, Алякундов — это «сын человека по имени Алякунд».

Менее вероятна, но возможна версия от календарного имени. В святцах нет имени Алякунд, но в просторечии греческое имя Каллиник (в переводе «добрый победитель») иногда искажалось до Калина, Калинка, а в некоторых говорах — до Аляка. Однако такое объяснение требует слишком много допущений и не объясняет суффикс -унд, который для русских фамилий нетипичен.

Географически фамилия Алякундов встречается в Поволжье и на Урале — в регионах, где веками жили рядом русские, татары и башкиры. Это косвенно подтверждает тюркскую гипотезу. Предки носителей фамилии, скорее всего, были крещёными татарами или башкирами, либо русскими, получившими прозвище от соседей-тюрок.

Словообразовательная модель проста: основа Алякунд + патронимический суффикс -ов. Фамилия не дворянская, не княжеская — она относится к крестьянской или мещанской среде, где прозвища часто закреплялись за целыми родами. В дореволюционных метрических книгах её можно встретить в записях о крестьянах Оренбургской, Уфимской или Казанской губерний.