Фамилия Алякундов редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Разбирать её начнём с суффикса: -ов в русских фамилиях указывает на притяжательность («чей?» — «Алякундов»). Значит, в основе лежало личное имя или прозвище Алякунд.

Самая вероятная версия связывает это прозвище с тюркским миром. В татарском или башкирском языках есть имя Алякун (варианты Алягун, Алякунды), которое складывается из двух частей: «ал» (возможные значения — «алый», «герой», «возьми») и «кун» (день, солнце). Под влиянием русской письменной фиксации конечное -д могло появиться как наращение, характерное для заимствованных слов (сравните: «арестант» из немецкого, хотя в оригинале без «д»). Таким образом, Алякундов дословно — «сын человека по имени Алякунд». Суффикс -унд для русских фамилий нетипичен, что дополнительно указывает на иноязычную основу.

Менее вероятна версия от календарного имени. В святцах нет имени Алякунд, но греческое Каллиник («добрый победитель») в просторечии иногда искажалось до Калина, а в некоторых говорах — до Аляка. Однако такое объяснение требует слишком много допущений и не объясняет появление суффикса -унд.

Географически фамилия Алякундов встречается в Поволжье и на Урале — в регионах, где веками жили рядом русские, татары и башкиры. Это косвенно подтверждает тюркскую гипотезу. Предки носителей фамилии, скорее всего, были крещёными татарами или башкирами, либо русскими, получившими прозвище от соседей-тюрок. Словообразовательная модель проста: основа Алякунд + патронимический суффикс -ов. Фамилия не дворянская, не княжеская — она относится к крестьянской или мещанской среде, где прозвища закреплялись за целыми родами. В дореволюционных метрических книгах её можно встретить в записях о крестьянах Оренбургской, Уфимской или Казанской губерний.