Фамилия Амагдобели — редкий случай, когда фамилия образована от целой фразы, а точнее — от грузинского причастия «ამაღდობელი» (амагдобели), что означает «воскресший» или «тот, кто воскрес». В основе лежит глагол «амагдоба» — «восходить, воскресать». Уже по форме видно, что фамилия нерусская: она закрепилась без типичных для русских фамилий суффиксов -ов, -ин или -ский, сохранив грузинское произношение почти без изменений.

Словообразовательная модель здесь необычна. Фамилия — это застывшая форма грузинского причастия, которая перешла в разряд фамилий напрямую. В Грузии такие фамилии часто давали детям, родившимся после долгого ожидания или после семейной беды, — как символ возрождения. Либо же прозвище «Амагдобели» мог получить священник или монах, чья жизнь была связана с праздником Пасхи или Воскресения Христова. То есть фамилия несёт не столько географическую, сколько семантическую нагрузку: её значение понятно любому грузину, знакомому с церковной лексикой.

Вероятнее всего, предки носителя этой фамилии были грузинами по происхождению. В Грузии фамилии на -ели обычно указывают на принадлежность к местности или роду занятий, но Амагдобели — исключение, так как образовано от религиозного термина. В России фамилия встречается в среде потомков грузинских эмигрантов или переселенцев XIX–XX веков. В архивных записях она могла искажаться: например, как «Амагдобель» или «Амагдобелидзе», но основная форма сохранила грузинский корень без изменений. В метрических книгах она попадается редко и воспринимается как экзотическая — даже в среде русских фамилий, образованных от целых выражений (вроде «Благонравов» или «Доброхотов»), Амагдобели стоит особняком из-за полного отсутствия славянской адаптации.