Фамилия Амалатов — хороший пример того, как за привычным русским окончанием может скрываться нерусская основа. На слух фамилия воспринимается как типичная русская на -ов, но её корень уводит в тюркские языки. В основе лежит мужское имя Амалат (варианты: Амалат, Амалет). У этого имени несколько возможных значений, и ни одно из них не доказано окончательно. Самая распространённая версия связывает его с арабским словом «амаль» (надежда, чаяние) — тогда Амалат это имя-пожелание. Другая гипотеза выводит его из тюркского «аманат» (залог, нечто доверенное на хранение), что в переносном смысле могло означать «верный», «надёжный». Третья, менее убедительная, отсылает к имени библейского персонажа Амалии (в русской традиции Амалия), но для фамилии Амалатов это маловероятно.

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Амалат добавили патронимический суффикс -ов. Получается, что Амалатов — буквально «сын Амалата». В русской среде такие фамилии массово возникали у крещёных татар, башкир, представителей других тюркских народов, чьи имена адаптировались к православной традиции. Встречается вариант написания через «о» — Амалатов, и через «а» — Амалатов (оба возможны, но первый закрепился в документах чаще).

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным тюркским влиянием: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также к местам исторического расселения служилых татар — например, Касимовский уезд. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании. Примечательно, что в некоторых говорах имя Амалат могли переосмыслить в духе русских прозвищ, связанных с глаголом «амалить» (медлить, мешкать), но это, скорее всего, вторичное народное толкование, а не истинная этимология.

Социальный статус предков-Амалатовых мог быть разным: от крестьян до служилых людей. Если фамилия возникла в среде крещёных татар, то носители её часто были ясачными крестьянами или мелкопоместными дворянами — в случае службы в казачьих или иррегулярных войсках. Точных сведений о сословной принадлежности всех Амалатовых нет, но общая закономерность такова: фамилии на -ов от тюркских имён обычно указывают на адаптацию нерусского населения в российском государстве, начиная с XVI–XVII веков.