Фамилия Аминхотепов — один из редких примеров, когда русская фамилия образована от имени древнеегипетского фараона или вельможи. В основе лежит имя Аменхотеп (в русской традиции часто передаваемое как Аминхотеп). Этот ономастикон — имя нескольких фараонов XVIII династии, в том числе Аменхотепа III и Аменхотепа IV (Эхнатона). Как имя собственное оно попало в русский язык через библейские тексты и историческую литературу XIX века.

Словообразовательная модель прозрачна: к основе Аминхотеп добавлен патронимический суффикс -ов. По такой же схеме в России образовывали фамилии от любых календарных и некалендарных имён: Иванов, Петров, Абрамов. Суффикс указывает на принадлежность — «сын Аминхотепа». Но здесь скрывается главная загадка: почему в крестьянской или мещанской среде, где фамилии закреплялись в XVIII–XIX веках, вдруг возникло египетское имя?

Самая правдоподобная версия — семинарское происхождение. В духовных училищах и семинариях России было принято давать будущим священникам «искусственные» фамилии, образованные от имён библейских и исторических персонажей. Имя Аменхотеп (Аминхотеп) встречается в Ветхом Завете как имя египетского сановника или царя (в синодальном переводе — Аменхотеп). Выпускник семинарии мог получить такую фамилию при поступлении или окончании училища, и она закреплялась за его потомками.

Менее вероятно, но не исключено, что фамилия могла возникнуть в среде старообрядцев или сектантов, которые иногда брали себе необычные библейские имена. Однако массового распространения имя Аминхотеп в народе не имело, поэтому фамилия осталась крайне редкой. Встретить её можно в основном в центральных регионах России, но точная география не прослеживается из-за малочисленности носителей.

Таким образом, фамилия Аминхотепов — скорее всего, книжного, семинарского происхождения. Предки носителя этой фамилии, вероятно, были выходцами из духовного сословия, и фамилия закрепилась как дань церковной образованности и интересу к библейской истории.