Фамилия Анаисова — редкая и неоднозначная по происхождению. Её основа — женское имя Анаис, которое может восходить к двум совершенно разным источникам. Первая и самая вероятная версия связывает имя Анаис с библейским именем Анна, что в переводе с древнееврейского означает «грация, миловидность». В такой форме — Анаис — имя встречается у евреев. В христианской традиции широко почитается Святая Анна, мать Богородицы; по преданию, она родила Марию после долгих лет бездетного брака, что придаёт имени дополнительный смысловой оттенок — долгожданное чудо.

Однако есть и другая, не менее интересная гипотеза. Имя Анаис могло быть персидским вариантом имени Анаитис — так звали древнюю богиню плодородия, почитавшуюся в арабских странах и Персии. С греческого её имя переводят как «зажигающая». Если принять эту версию, то именование Анаис давали в честь языческой богини, а фамилия Анаисова оказывается связана с дохристианскими культами плодородия.

Словообразовательная модель здесь проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Анаисова — это «дочь или жена человека по имени Анаис». Поскольку имя женское, фамилия в такой форме закрепилась за женщиной, а мужской вариант — Анаисов — мог относиться к её отцу или мужу. Фамилия настолько редкая, что говорить о её географическом или сословном ареале сложно: она могла возникнуть в любой среде, где бытовало имя Анаис, будь то еврейские общины, регионы с персидским влиянием или православные семьи, использовавшие редкую форму имени Анна.