Фамилия Анепияев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, суффикс и ударение заставляют задуматься: перед нами, скорее всего, искусственное или книжное образование, а не народное прозвище, передававшееся веками.

Если отбросить суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Анепия), в центре оказывается имя или прозвище Анепий. В русской ономастике такого имени нет. Ближайшая параллель — греческое имя Онисим (Ἀνήσιμος), означающее «полезный», «исполнительный». В просторечии оно могло трансформироваться в Онисий, Анисий, а через акающее произношение (Онепий → Анепий) дать основу для фамилии. Версия правдоподобна: греческие имена через церковные святцы активно входили в русский обиход, особенно в среде духовенства.

Второй вариант — фамилия могла возникнуть в семинарской среде. Священникам нередко давали «благозвучные» фамилии, образованные от латинских или греческих корней. Анепияев может быть переделкой латинского anepius («неплемянник», то есть безродный, одинокий) или греческого anepios (двоюродный брат). В этом случае фамилия — не от прозвища предка, а от книжного слова, выбранного наставником для ученика.

Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает её связь с духовным сословием — именно там было распространено «изобретение» фамилий по церковным календарям и латинским штудиям. Никаких известных дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что также склоняет к версии о происхождении из среды причетников или крестьян, получивших фамилию от местного священника.

Таким образом, Анепияев — фамилия-загадка, в которой с большой вероятностью скрывается либо искажённое каноническое имя, либо семинарская «выдумка». Её носителям стоит искать корни не в ремесле или прозвище, а в церковных записях XVIII–XIX веков.