Фамилия Анипатисов сбивает с толку с первого взгляда. Она выглядит как типичный патроним на -ов, но имени или прозвища Анипатис не существует ни в святцах, ни в славянском именослове. В этом и заключается главная загадка: перед нами не народная, а искусственная фамилия, каких много появилось в XVIII–XIX веках в среде русского духовенства.

Семинаристам и выпускникам духовных училищ часто давали фамилии, образованные от латинских или греческих слов, — чтобы подчеркнуть их образованность и отделить от крестьянского сословия. Основа «Анипатис» восходит, скорее всего, к латинскому «Anipatus» или греческому «ἀνίπατος» (anipatos) со значением «непобедимый» или «непревзойдённый». Суффикс -ис в этом случае — не славянский, а калька с греческого окончания, которое при русификации превратилось в -исов. Фамилия писалась сразу с двумя «с» на конце, потому что суффикс -ов присоединился прямо к основе, без сокращений.

Существует и вторая версия, но она заметно слабее. Якобы фамилия могла возникнуть от прозвища, данного человеку с необычной походкой: в диалектах слово «патить» (от «пат» — след) означало «топать», «ступать», а греческая приставка «ан-» давала отрицание — «неступающий», «медлительный». Однако ни в одном реальном говоре такого сложного слова не зафиксировано, поэтому версия остаётся гипотетической.

География фамилии подтверждает её искусственное происхождение. Анипатисовы встречаются единично, в основном в центральных областях России и в Поволжье — именно там располагались духовные училища, где практиковали такие «книжные» фамилии. Носители фамилии, скорее всего, потомки выходцев из духовного сословия, получивших её по решению наставника или по месту учёбы. Сравните с возможным вариантом Анипатин: суффикс -ин указывал бы на происхождение от женского имени или прозвища, но в данном случае выбрана мужская модель на -ов, что типично для семинарских фамилий.