Фамилия Анипко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Антип. Мужское крестильное имя Антип в переводе с греческого означает «отчим». В основу фамилии легла производная форма имени — Анип. Согласно другой гипотезе, фамилия Анипко восходит к арабскому женскому имени Анипа - «истинная, настоящая». Поэтому Анипко буквально понималось как «сын Анипа».