Фамилия Анокина — женская форма от Анокин, а та, в свою очередь, — один из вариантов фамилии Анохин. Ключ к её пониманию — в чередовании гласных в корне. Исходная основа — каноническое имя Онуфрий (греч. «святой»), которое в народной русской речи звучало как Аноха. В некоторых говорах, особенно под влиянием аканья и упрощения произношения, «Аноха» могла превратиться в «Анока». От этого просторечного имени и пошла фамилия: чей? — Анокин, то есть сын или потомок Аноки.

Суффикс -ин указывает на принадлежность, типичную для северных и центральных областей России. В отличие от фамилий на -ов, которые часто образовывались от названий профессий (Кузнецов) или прозвищ с твёрдой основой, -ин крепко привязан к именам и прозвищам, оканчивающимся на -а/-я. Таким образом, Анокина — это «жена или дочь Анокина», а первоначально — просто «относящаяся к Аноке».

В дореволюционной переписи и в современных справочниках фамилия Анокина встречается реже, чем Анохина. Это говорит о том, что форма «Анока» была локальной, диалектной. Географически она чаще фиксируется в Поволжье и на юге России, где аканье и редукция гласных были особенно сильны. В старых документах можно встретить написание «Анокины» — с ударением на второй слог, что подтверждает народное происхождение.

Интересная деталь: имя Онуфрий и его производные (Аноха, Ануфрий) были широко распространены в крестьянской и купеческой среде, но почти не встречались у дворянства. Поэтому фамилия Анокина — маркер социального происхождения: её носители почти наверняка из крестьян или мещан, а не из привилегированных сословий. Никакой другой, более древней или иноязычной версии у этой фамилии нет — это чисто русская, народная модель, возникшая не раньше XVII века.