Фамилия Анонченко — один из тех случаев, когда внешне прозрачная форма таит в себе неочевидный корень. На слух основа «Анон» кажется полным именем, но в православных святцах такого нет. Разгадка лежит в народной переделке церковного имени Онуфрий. В украинской среде его упрощали до Анона, Анохи или Аноша — отбрасывали начальный звук и меняли звучание на более привычное. От этого бытового варианта и пошла фамилия.

Суффикс -енко — классический украинский патронимик, означающий «сын» или «потомок». Но здесь он крепится не прямо к основе Анон, а к уменьшительной форме Анонча. Показатель -ча в украинской антропонимии играл роль ласкательного суффикса: как Иван превращался в Иванчу, так и Анон становился Анончей. Таким образом, Анонченко — это буквально «сын Анончи», то есть потомок человека, которого в быту звали ласковым производным от Онуфрия.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине. В дореволюционных переписях Анонченко встречаются преимущественно среди казацкого и крестьянского сословий — суффикс -енко в малороссийской среде прочно ассоциировался с простонародным происхождением, в отличие от польских или великорусских фамильных окончаний. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Показательно сравнение с фамилией Анохин. У них общая основа (Аноха от Онуфрий), но русский суффикс -ин передаёт принадлежность («чей?» — Анохин), а украинский -енко — родство по прямой линии («сын кого?»). Анонченко сформировалась уже после закрепления украинской словообразовательной традиции в XVI–XVII веках, когда патронимический суффикс стал не просто обозначением отцовства, а фамильным маркером. Так что это не случайное искажение имени, а закономерный продукт живого народного именослова, где церковная форма прошла через бытовую переработку и закрепилась в фамилии.