Фамилия Анонимус — редчайший случай в русском ономастиконе. Если подавляющее большинство русских фамилий образовано от прозвищ, имён или профессий (Кузнецов, Иванов, Смирнов), то Анонимус стоит особняком: её основа — латинское слово «anonymus» (безымянный, от греч. «anōnymos»). Это сразу указывает на искусственное, книжное происхождение, а не на народную традицию.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. В русской фамильной системе суффиксы -ов/-ев, -ин, -ский присоединяются к основе, чтобы указать на принадлежность («чей?»). Анонимус же — это чистая латинская лексема, оформленная как фамилия без какого-либо русского суффикса. Такое возможно только в среде, где латынь была языком образования и документов: в духовных семинариях и академиях Российской империи.

Самый вероятный путь появления фамилии — семинарская среда. С XVIII века, а особенно в XIX, будущим священникам при поступлении в духовные училища нередко меняли «неблагозвучные» или простонародные фамилии на более книжные, благородные. Латинские и греческие корни были в ходу: Розов, Ливанов, Сперанский (от лат. spero — надеюсь). Анонимус могла быть дана либо круглому сироте, чьё происхождение было неизвестно («безымянный»), либо выпускнику, скрывшему свою фамилию. Вторая версия — прозвище, закрепившееся за человеком, который скрывал имя или подписывал труды псевдонимом, но в условиях семинарии это менее вероятно.

Географически фамилия не привязана к одной губернии, но чаще встречается в регионах с развитой системой духовных школ: центральная Россия (Владимирская, Костромская, Ярославская губернии), а также Украина и Белоруссия (Киевская, Черниговская, Могилёвская). В приходских метрических книгах Анонимусы — это, как правило, дети священников и дьячков.

Сравнение с однокоренными фамилиями показательно: Инкогнитов (от лат. incognitus — неузнанный) и Безымянный — прямые аналоги. Но Анонимус — самая латинизированная форма, что выдаёт высокий уровень образованности того, кто её придумал или получил. Дворянам такие фамилии давали редко: в их среде ценились родовые прозвания.

Социальный контекст здесь ключевой: Анонимус — не крестьянская и не купеческая фамилия. Это маркер духовного сословия, «искусственная» фамилия, созданная за письменным столом. Носитель такой фамилии в XIX веке почти наверняка был связан с церковью или, реже, с академической средой. Сегодня она остаётся крайне редкой, и каждый её носитель — наследник не просто прозвища, а целой истории о том, как русская церковь «латинизировала» своих служителей.