Фамилия Антыпко звучит на южный, украинский лад. Её основа — каноническое православное имя Антип, которое в украинской народной традиции часто произносили как Антып. Имя это греческое, происходит от «антипатос» — «упорный», «противник» (или, по другой версии, «отчим»). В святцах известен святой Антипа Пергамский, почитаемый как целитель.

Модель образования здесь прозрачна и типична для западно- и южнорусских земель. Суффикс -к- в фамилиях (Антыпко, Федько, Петренко) изначально был уменьшительным, а затем закрепился как семейный показатель. Прямое значение фамилии — «маленький Антып» или «сын Антыпа». В украинской ономастике такие фамилии на -ко — одна из самых массовых групп, и Антыпко стоит в этом ряду.

В отличие от русских фамилий на -ов (Антипов), где ударение падает на основу, в фамилии Антыпко ударение, скорее всего, на последний слог — Антыпко́, что также выдает её украинское происхождение. Встречается она преимущественно на Черниговщине, Полтавщине, в Сумской области, а также среди потомков переселенцев в Краснодарском крае.

Интересно, что имя Антип в народе было не слишком частым, но фамилий от него образовалось несколько: Антипов, Антипин, Антыпко, Антипенко, Антипьев. Антыпко выделяется на их фоне тем, что фамилия не «притянула» к себе стандартный русский суффикс, а сохранила живую украинскую форму, где суффикс -к- выполняет роль и уменьшительности, и принадлежности. Социально это, скорее всего, фамилия крестьянская или казацкая, без дворянского оттенка.