Фамилия Анущенков — редкий пример, где исходное имя не лежит на поверхности, а суффикс подсказывает географию. Основа здесь — Анущенко, а конечное -ов превращает её в типичную русскую фамилию по модели «чей?». То есть Анущенков — это сын Анущенко, внук человека, которого в документах записали как Анущенко. Такая двойная суффиксация (-енк- + -ов) встречается реже, чем простая, и чаще всего указывает на украинские или южнорусские корни семьи, которые позже адаптировались в великорусской среде.

Само имя Анущенко образовано от Анущ, Ануща — это уменьшительная форма от канонического имени Иоанн (в русском обиходе Иван). В украинской и белорусской традиции имя Иван давало целое гнездо производных: Иван → Иванко → Иванченко, но через диалектное произношение «Иван» могло звучать как «Аван», отсюда Анущ, Анущенко. Менее вероятная, но допустимая версия — связь с именем Ануфрий (просторечное Ануха, Анушка), хотя тогда ожидалась бы форма Ануфриенков или Анухов.

В ономастике фамилии на -енков (с русским суффиксом -ов) характерны для регионов, где украинская модель на -енко столкнулась с русской патронимической системой: Курская, Воронежская, Ростовская области, а также области бывшего Слободской Украины. Анущенковы, скорее всего, происходят из этой полосы. Социально — потомки крестьян или казаков, поскольку фамилии на -енко в массе своей недворянские и широко распространились в XVII–XVIII веках среди простого люда.

Запись фамилии могла колебаться: в метрических книгах встречается и Анущенков, и Анущенко, и даже Анущинков — из-за нестабильности суффикса на стыке двух языковых традиций. Сегодня это редкая фамилия, не входящая в списки массовых, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска именно в указанных южных регионах.